掌握基因組學這個學科的起源和發(fā)展史、理念和基本概念、研究領域和核心技術,特 別是基因組學對生命科學和生物技術的全面貢獻。從不同角度概括了基因組學這一學科的 定義、理念、源流發(fā)展趨勢及應用范例,了解基因組學相關技術在生命科學和生物產業(yè)中 的地位及其對人類社會的影響。
(一)課程任務
本課程是是研究生物染色體上全體基因總和的一門學問,通過對基因組信息以及相關數據系統利用,試圖解決生物、醫(yī)學和工業(yè)領域的重大問題的一門技術學科。基因組學主要分為以全基因組測序為目標的結構基因組學和以基因功能鑒定為目標的功能基因組學。要求學生掌握結構基因組學中第一代到第四代DNA測序方法的主要原理,短片段DNA如何組裝成整個染色體的基本原理和生物信息學技術;結構基因組學中的基因過量表達、基因敲除,RNAi等高通量基因功能研究方法。
(二)課程目標
《基因組學》的教學目標是要求學生在學習中以基因組為主線,掌握基因組測序的基本原理、如何對基因功能進行驗證,了解基因組學的學科前沿發(fā)展動態(tài),關注學科研究中的熱點問題,學習中注意綜合運用各學科相關知識,理性思維,理順脈絡,聯系實際,拓寬思路,以達到培養(yǎng)訓練學生分析問題和解決問題能力,增強創(chuàng)新意識,提高綜合素質。
三、教學內容和要求
第一章 基因組學概論
介紹基因組學的基本概念和研究內容,使學生了解基因組學的過去、現在和將來的發(fā)展趨勢。
1. 掌握:結構基因組學、比較基因組的含義;
2. 熟悉:人類基因組計劃。
重點與難點:基因組學概念,基因組學研究的對象和任務。
第二章 表觀基因組
在基因組的水平上研究表觀遺傳修飾的學科。
1. 了解:表觀遺傳學的概念;
2. 掌握:基因組的表觀修飾及其作用。
重點:DNA甲基化的概念及作用機理。
第三章 結構基因組學
介紹以全基因組測序為目標的結構基因組學。
1. 掌握:第一代到第四代DNA測序方法的主要原理;
2. 熟悉:短片段DNA如何組裝成整個染色體的基本原理和生物信息學技術
重點:DNA測序方法的主要原理。
難點:相關生物信息學技術。
第四章 比較基因組學
對已知基因組的結構進行比較,了解基因的功能,探究基因組的進化
1. 了解比較基因組學的意義;
2. 掌握如何利用比較基因組學探究基因功能。
重點與難點:如何利用比較基因組學探究基因功能。
第五章 功能基因組
通過實驗方法驗證基因組學中大量基因的功能。
1. 掌握:基因過量表達、基因敲除;
2. 熟悉:RNAi;
重點:相關實驗方法的基本原理。
課程目錄
0.1 基因組計劃緣起
0.2 基因組學重要進展
1.1 DNA RNA 蛋白質
1.2 基因組結構特征
2 遺傳圖繪制
3 物理圖繪制
4.1 基因組測序技術
4.2 全基因組測序
5.1 基因組注釋信息分析
5.2 基因組注釋實驗驗證
5.3 基因組編輯
6.1 真核生物基因組
6.2 原核生物及細胞器基因組
7.1 基因的轉錄調控-PolI-PolIII
7.2 基因的轉錄調控-PolII
8.1 組成與加工
8.2 定位與降解
8.3 miRNA
8.4 siRNA
8.5 lncRNA